Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF397Q8NF99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF397Q8NF99 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms