Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NECAB1Q8N987 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NECAB1Q8N987 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms