Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC33Q8N5R6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms