Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2BQ8N4Y2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2BQ8N4Y2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRACR2BQ8N4Y2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CRACR2BQ8N4Y2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRACR2BQ8N4Y2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms