Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOT1Q8IXI2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOT1Q8IXI2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms