Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PBRM1Q86U86 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PBRM1Q86U86 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PBRM1Q86U86 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms