Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2Q1Q7Z7E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2Q1Q7Z7E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms