Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMIM15Q7Z3B0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms