Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX8Q6ZV50 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX8Q6ZV50 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms