Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSTM1Q6UX27 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VSTM1Q6UX27 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms