Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHISA2Q6UWI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms