Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L2Q6R6M4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L2Q6R6M4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms