Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMBQ6PCB8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMBQ6PCB8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms