Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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CSAG1Q6PB30 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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CSAG1Q6PB30 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CSAG1Q6PB30 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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