Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6P435 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6P435 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6P435 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6P435 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6P435 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms