Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RHBDD2Q6NTF9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms