Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E4F1Q66K89 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E4F1Q66K89 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms