Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AGAP6Q5VW22 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AGAP6Q5VW22 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms