Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GKAP1Q5VSY0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms