Protein–RNA interactions for Protein: Q5T442

GJC2, Gap junction gamma-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC2Q5T442 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC2Q5T442 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC2Q5T442 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms