Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C6orf141Q5SZD1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C6orf141Q5SZD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms