Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSGA10IPQ3SY00 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms