Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTU2Q2VPK5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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