Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL40Q2TBA0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL40Q2TBA0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms