Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CCDC142Q17RM4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC142Q17RM4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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