Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTL8BQ17RB0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RTL8BQ17RB0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTL8BQ17RB0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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