Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IMPG1Q17R60 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IMPG1Q17R60 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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