Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDUFA9Q16795 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDUFA9Q16795 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms