Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RBBP7Q16576 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RBBP7Q16576 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RBBP7Q16576 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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RBBP7Q16576 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP7Q16576 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms