Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC37Q16543 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC37Q16543 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms