Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F4Q16254 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F4Q16254 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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