Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CYTH1Q15438 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms