Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBM39Q14498 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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