Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARF1Q14162 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARF1Q14162 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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