Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1CQ14123 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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