Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGB1Q14028 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CNGB1Q14028 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGB1Q14028 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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