Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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GTF2H3Q13889 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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