Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKD2Q13563 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
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