Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RCAN1-211ENST00000489903 2276 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.669e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-204ENST00000399272 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.679e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TBC1D20-202ENST00000461188 5195 ntTSL 210.83□□□□□ -0.689e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 AC087521.3-202ENST00000526408 743 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.719e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-207ENST00000481448 2816 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.719e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 METTL4-205ENST00000576251 1884 ntTSL 210.47□□□□□ -0.739e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-203ENST00000381135 2526 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.759e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PPP4R1-222ENST00000582594 2982 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.759e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-205ENST00000443408 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.759e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-210ENST00000487990 2520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.779e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.789e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PUS3-205ENST00000613398 1419 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.819e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.859e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-211ENST00000559257 2217 ntTSL 59.69□□□□□ -0.869e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PUS3-201ENST00000227474 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TOPBP1-202ENST00000503338 618 ntTSL 39.27□□□□□ -0.939e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RCAN1-209ENST00000487434 300 ntTSL 39.25□□□□□ -0.939e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.939e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC23-206ENST00000482948 737 ntTSL 29.2□□□□□ -0.949e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KIAA1551-203ENST00000397578 814 ntTSL 39.06□□□□□ -0.969e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KIAA1551-204ENST00000535596 965 ntTSL 28.58□□□□□ -1.049e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TTC19-207ENST00000481107 3075 ntTSL 28.43□□□□□ -1.069e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.079e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MRPL23-209ENST00000484918 232 ntTSL 58.3□□□□□ -1.089e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.099e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TOPBP1-203ENST00000503464 525 ntTSL 27.77□□□□□ -1.179e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.179e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KIAA1551-208ENST00000543763 883 ntTSL 27.35□□□□□ -1.239e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.259e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.289e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMPO-213ENST00000556678 713 ntTSL 57.02□□□□□ -1.299e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.359e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.369e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.49e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.449e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 METTL4-202ENST00000573134 5190 ntTSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.59e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 MAPK1IP1L-202ENST00000553976 517 ntTSL 35.45□□□□□ -1.549e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.559e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TTC19-202ENST00000465567 2801 ntTSL 1 (best)5.37□□□□□ -1.559e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNF138-203ENST00000430838 2308 ntTSL 25.01□□□□□ -1.619e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMPO-211ENST00000552831 743 ntTSL 24.84□□□□□ -1.639e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.79e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.779e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.779e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DMXL1-206ENST00000505312 3448 ntTSL 1 (best)1.73□□□□□ -2.139e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.179e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DMXL1-213ENST00000514595 3590 ntTSL 20.89□□□□□ -2.279e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.331e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-203ENST00000535297 395 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-208ENST00000545210 579 ntTSL 314.27□□□□□ -0.131e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-201ENST00000257262 468 ntTSL 310.14□□□□□ -0.791e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 TMEM258-206ENST00000541893 517 ntTSL 56.39□□□□□ -1.391e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.024e-8■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 223.74■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 222.92■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 221.56■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 24.7
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PABPC4Q13310 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 NENF-202ENST00000472389 459 ntTSL 317.76■□□□□ 0.431e-11■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 312.13□□□□□ -0.479e-19■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 326.8■■□□□ 1.882e-46■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 24.7
PABPC4Q13310 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 215.5■□□□□ 0.078e-15■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 CD63-205ENST00000548117 499 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-9■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.684e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.09■■□□□ 1.294e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 562 ntAPPRIS P5 TSL 320.56■□□□□ 0.884e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 TMEM256-203ENST00000576017 511 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.56□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 321.68■■□□□ 1.065e-13■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 PAPSS1-208ENST00000514815 296 ntTSL 514.69□□□□□ -0.065e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 HDLBP-220ENST00000442730 683 ntTSL 226.62■■□□□ 1.858e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 HDLBP-240ENST00000484412 669 ntTSL 516.62■□□□□ 0.258e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 PCBD1-202ENST00000493228 732 ntTSL 218.72■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 PCBD1-203ENST00000493961 389 ntTSL 214.25□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUP155-206ENST00000508182 702 ntTSL 25.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 NUP155-203ENST00000502533 1896 ntTSL 53.6□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.395e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 VEGFB-204ENST00000543462 663 ntTSL 211.68□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 EIF3H-212ENST00000611080 1265 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.687e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.827e-8■■■■□ 24.6
PABPC4Q13310 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.457e-8■■■■□ 24.6
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