Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF1Q13077 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF1Q13077 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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