Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSTF3Q12996 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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