Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSPB3Q12988 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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