Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YEL075CYEL075C 369 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YLR108CYLR108C 1458 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YJL202CYJL202C 348 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YKL177WYKL177W 339 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 snR11snR11 258 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 CAF20YOR276W 486 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YGR273CYGR273C 525 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YPL035CYPL035C 348 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YBR138CYBR138C 1575 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 SET3YKR029C 2256 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YDL050CYDL050C 372 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 OMA1YKR087C 1038 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 SSP1YHR184W 1716 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 HUL5YGL141W 2733 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 PCL9YDL179W 915 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YGR149WYGR149W 1299 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 RPL16AYIL133C 600 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 MNL2YLR057W 2550 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 APL1YJR005W 2103 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 RPS17BYDR447C 411 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 YKL069WYKL069W 543 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 RIO2YNL207W 1278 nt1.03□□□□□ -2.24
TY1B-BLQ12490 TRM12YML005W 1389 nt1.03□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 APL3YBL037W 3078 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 ASG1YIL130W 2895 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 SPR3YGR059W 1539 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YDR355CYDR355C 303 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt1.02□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 SDC1YDR469W 528 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 CSM2YIL132C 642 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 MRP2YPR166C 348 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YCS4YLR272C 3531 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 TFB1YDR311W 1929 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 KAP120YPL125W 3099 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 LEU3YLR451W 2661 nt1.01□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 CAT2YML042W 2013 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YIL082WYIL082W 873 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 HRT3YLR097C 1035 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YLR140WYLR140W 327 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 SPC29YPL124W 762 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 SRP1YNL189W 1629 nt1□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YOR314WYOR314W 330 nt0.99□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 CTK1YKL139W 1587 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 MON1YGL124C 1935 nt0.98□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 AEP3YPL005W 1821 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 TRM2YKR056W 1920 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YDL186WYDL186W 834 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 MMF1YIL051C 438 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 YLR053CYLR053C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 MSS4YDR208W 2340 nt0.97□□□□□ -2.25
TY1B-BLQ12490 MGE1YOR232W 687 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 MAL33YBR297W 1407 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 SMD3YLR147C 306 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 RGM1YMR182C 636 nt0.96□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YIL058WYIL058W 285 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 ALG5YPL227C 1005 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 CLG1YGL215W 1359 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 AVT5YBL089W 1380 nt0.95□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 PDS5YMR076C 3834 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 GPN3YLR243W 819 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YIP3YNL044W 531 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 NOP15YNL110C 663 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 DPB3YBR278W 606 nt0.94□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 UBC13YDR092W 462 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 BNS1YGR230W 414 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 AIM36YMR157C 768 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 PUS9YDL036C 1389 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YDR124WYDR124W 975 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 ACA1YER045C 1470 nt0.93□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 RIT1YMR283C 1542 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 STE5YDR103W 2754 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 HAP4YKL109W 1665 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 CTF18YMR078C 2226 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 MSS2YDL107W 1056 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 FIP1YJR093C 984 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YLR400WYLR400W 474 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 MPD1YOR288C 957 nt0.92□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 FMN1YDR236C 657 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 RNH202YDR279W 1053 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YGR190CYGR190C 366 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YGR290WYGR290W 444 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 YBL077WYBL077W 432 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 CCL1YPR025C 1182 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 GCD2YGR083C 1956 nt0.9□□□□□ -2.26
TY1B-BLQ12490 POL4YCR014C 1749 nt0.9□□□□□ -2.26
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