Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YOL106WYOL106W 354 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 MET18YIL128W 3099 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 SAG1YJR004C 1953 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RTT107YHR154W 3213 nt1.85□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 VPS8YAL002W 3825 nt1.84□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 ATG9YDL149W 2994 nt1.84□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 RUD3YOR216C 1455 nt1.84□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 VID24YBR105C 1089 nt1.84□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 MED8YBR193C 672 nt1.84□□□□□ -2.11
SNF8Q12483 GYP5YPL249C 2685 nt1.84□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 TRL1YJL087C 2484 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 PUT3YKL015W 2940 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YNL034WYNL034W 1839 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 UBC5YDR059C 447 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 DAD4YDR320C-A 219 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 PEA2YER149C 1263 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 GIM5YML094W 492 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 REV1YOR346W 2958 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 RXT2YBR095C 1293 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SUS1YBR111W-A 291 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 MUD1YBR119W 897 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 INO80YGL150C 4470 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SSF2YDR312W 1362 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SEC31YDL195W 3822 nt1.83□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 FKS1YLR342W 5631 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 RPS26BYER131W 360 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 STE2YFL026W 1296 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 ATG38YLR211C 681 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YOL150CYOL150C 312 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 RBL2YOR265W 321 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 NIC96YFR002W 2520 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 BUD2YKL092C 3315 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 DFG16YOR030W 1860 nt1.82□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 PDR8YLR266C 2106 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YDL157CYDL157C 357 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 FMP16YDR070C 282 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 LOC1YFR001W 615 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YFR056CYFR056C 369 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SFM1YOR021C 642 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 ECM25YJL201W 1800 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 ASG1YIL130W 2895 nt1.81□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 MPH1YIR002C 2982 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YCR100CYCR100C 951 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 NCB2YDR397C 441 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 RSM28YDR494W 1086 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 PRS3YHL011C 963 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YIL058WYIL058W 285 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SHE2YKL130C 741 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 GIM3YNL153C 390 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 SFG1YOR315W 1041 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 ECM5YMR176W 4236 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 LEU3YLR451W 2661 nt1.8□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 KAR9YPL269W 1935 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YGR242WYGR242W 309 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 TMA7YLR262C-A 195 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YOR169CYOR169C 465 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 NSL1YPL233W 651 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 STD1YOR047C 1335 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 GDI1YER136W 1356 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 RNH70YGR276C 1662 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YJL016WYJL016W 1686 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 CDC60YPL160W 3273 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 MGA2YIR033W 3342 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 HER1YOR227W 3741 nt1.79□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 VPS15YBR097W 4365 nt1.78□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 GAL80YML051W 1308 nt1.78□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 COX13YGL191W 390 nt1.78□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YLR217WYLR217W 324 nt1.78□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 YBL108WYBL108W 306 nt1.78□□□□□ -2.12
SNF8Q12483 UBP11YKR098C 2154 nt1.78□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 CAT2YML042W 2013 nt1.78□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 GPI8YDR331W 1236 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YGL230CYGL230C 444 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YET1YKL065C 621 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YAL064WYAL064W 285 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 VPS63YLR261C 327 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 ARL3YPL051W 597 nt1.77□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 RSM27YGR215W 333 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YHR210CYHR210C 1026 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 SNC1YAL030W 354 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 RLP24YLR009W 600 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YLR198CYLR198C 360 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 TOA1YOR194C 861 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YOR333CYOR333C 417 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 PTC5YOR090C 1719 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 SSQ1YLR369W 1974 nt1.76□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 DIS3YOL021C 3006 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 SSY1YDR160W 2559 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 IRC4YDR540C 540 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 SDL1YIL167W 633 nt1.75□□□□□ -2.13
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