Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC173Q0VFZ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms