Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2orf54Q08AI8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2orf54Q08AI8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms