Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DHX9Q08211 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms