Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC18A2Q05940 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms