Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYP4A11Q02928 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms