Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms